En la reunión se ha acordado la territorialización de 154.007.114 euros, de los que 136.835.000 euros para programas agrícolas y ganaderos, 16.282.344 para sanidad de la producción agraria y 889.770 euros para líneas de actuación de la industria alimentaria.

Programas agrícolas y ganaderos

La Conferencia Sectorial ha acordado el reparto entre las Comunidades Autónomas de 123.225.000 euros correspondientes a la medida de reestructuración y reconversión del viñedo.
 
Además, se han destinado 13.610.000 euros a la mejora del sector de frutos de cáscara y las algarrobas, que se distribuirá entre las Comunidades Autónomas en función de la superficie determinada correspondiente a esta campaña 2012-2013.

Sanidad de la producción agraria

De la cantidad asignada en este apartado, 9.258.064 corresponden al programa de lucha contra plagas, para la erradicación de organismos nocivos de cuarentena o nuevos en el territorio nacional, tanto si es objeto de financiación comunitaria a cargo de los Fondos de Solidaridad o sin posibilidad de financiación comunitaria, y cuya erradicación es obligatoria por la normativa comunitaria o española.

Asimismo, esta partida está destinada al control de la langosta y otros ortópteros, así como el control de organismos nocivos establecidos en el territorio nacional (red de seguimiento de las poblaciones de la mosca de la fruta).

Otros 3.500.000 euros se destinan al fomento del asociacionismo para la defensa sanitaria ganadera, cuyos importes a distribuir se ha calculado mediante la aplicación de una fórmula, adoptada por consenso con las CCAA  en el año 2007, que tiene en cuenta el grado de implantación de dichas asociaciones en cada territorio, así como el grado de integración de explotaciones y de censos en dichas asociaciones.

Además, se han repartido 2.220.040 euros para el fomento de agrupaciones fitosanitarias y de producción integrada. Para el cálculo de las asignaciones correspondientes se ha partido de las cantidades solicitadas por las Comunidades Autónomas, a las que se han descontado los remanentes existentes de ejercicios anteriores.

Para la mejora de la calidad y trazabilidad de los sectores ganaderos, identificación de ovinos y caprinos, la Conferencia Sectorial ha territorializado 659.142 euros Esta cantidad está destina a cofinanciar la compra de los elementos de identificación y registro de los animales de las especies ovina y caprina.

Según establece la normativa comunitaria, estos sistemas son obligatorios para todos los animales nacidos después del 9 de julio de 2005 y para todos los intercambios intracomunitarios y exportaciones que se realicen a partir de esa fecha. Desde la entrada en vigor del nuevo sistema, los animales deberán ser identificados mediante un doble medio de identificación, que en el caso de España se ha decidido que sean una marca auricular o crotal, y un identificador electrónico. 

En el marco de la Sanidad de la Producción Agraria también se han distribuido 349.343 euros para el Plan Integral de Subproductos. Estas subvenciones se contemplan en la normativa sobre ayudas estatales destinadas a las explotaciones ganaderas, industrias agroalimentarias y establecimientos de gestión de subproductos, para la mejora técnica de gestión de subproductos de origen animal no destinados a consumo humano.

Asimismo, se han destinado 201.760 euros al programa de prevención de plagas. En la presente propuesta de distribución se han incluido solamente los laboratorios colaboradores con los programas nacionales de prospecciones fitosanitarias, cuarentena y de erradicación.

Por último, 93.995 de han destinado a los programas estatales de control y erradicación de las Encefalopatías Espongiforme Transmisibles (ETT's) y otras enfermedades de los animales. Esta asignación se realiza para ajustar la distribución de fondos.

Industrias agroalimentaria

Dentro de este capítulo se ha aprobado el reparto de 889.770 euros para el programa de fomento del consumo de fruta en las escuelas. Estos fondos deben destinarse preferentemente a la realización de medidas de acompañamiento y, en segunda instancia, si fuera necesario, se podrán destinar a atender la adquisición y distribución de fruta, con el fin de no perder la financiación comunitaria asignada.